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電子病歷知識(shí)庫檢索

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    隨著信息科學(xué)和計(jì)算機(jī)技術(shù)的發(fā)展,醫(yī)院信息系統(tǒng)的開發(fā)小斷深入,電子病歷作為臨床醫(yī)療信息基礎(chǔ), 逐漸成為現(xiàn)代化醫(yī)院綜合信息系統(tǒng)的核心。電子病歷是患者的訴求,電子病歷既便于跟蹤患者的病患情況,有針對(duì)性地對(duì)患者的病情進(jìn)行跟蹤診斷和治療,又有助于患者減少重復(fù)檢查次數(shù),為患者節(jié)省很多醫(yī)療費(fèi)用,節(jié)省寶貴的最件診治時(shí)問,電子病歷會(huì)將新補(bǔ)充的信息與已存在的所有信息建立必要的聯(lián)系,對(duì)患者的狀態(tài)進(jìn)行綜合分析和診斷,主動(dòng)提示相關(guān)生或患者,提出檢察、治療汁劃等,因此電子病歷具有傳統(tǒng)病無法比擬的優(yōu)勢(shì)。何有效利用電子病歷數(shù)據(jù)庫中存儲(chǔ)的大數(shù)據(jù)輔助醫(yī)生進(jìn)行分析研究與診斷,捉高效率和準(zhǔn)確性,已成為待解決的問題。

    本體的提出使得電子病分析技術(shù)從基于文本、內(nèi)容層面提升到語義概念的層面。水體是足慨念模的明確的形式化規(guī)范說明,本體描述了概念的內(nèi)涵以及概念與慨念之間的關(guān)系,具有良好的概念層次結(jié)構(gòu)和對(duì)邏輯推的支持。模糊本體和一般本體最大的區(qū)別在于,模糊小體有隸屬度的概念存在、在處理不確切的信息上更具有彈性和優(yōu)勢(shì)。
     目前,國(guó)外很多學(xué)者正在醫(yī)學(xué)本體領(lǐng)域進(jìn)行著深入的探索,如美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館主持的一項(xiàng)長(zhǎng)期研究和開發(fā)計(jì)劃,即統(tǒng)一醫(yī)學(xué)語言系統(tǒng),該研究計(jì)劃目的是要開發(fā)機(jī)讀的知識(shí)資源,使許多不同的應(yīng)用程序利用它來彌補(bǔ)不同機(jī)讀資源的差異,從而識(shí)別與特定用戶需求密切相關(guān)的信息資源。同時(shí),國(guó)內(nèi)也有一些學(xué)者正在研究如何將本體應(yīng)用于醫(yī)學(xué)檢索領(lǐng)域。西安電子科技大學(xué)的鞏沐歌以高血壓電子病歷為例,將本體知識(shí)庫與高血壓電子病歷中的診斷知識(shí)結(jié)合起來,構(gòu)建基于本體的具有智能推理功能的高血壓電子病歷知識(shí)庫,為醫(yī)學(xué)領(lǐng)域?qū)<医⒖晒蚕?、可?fù)用的電子病歷知識(shí)庫系統(tǒng)。要芳等人運(yùn)用本體語言構(gòu)建了電子病歷知識(shí)庫,進(jìn)而運(yùn)用粗糙集和決策樹方法對(duì)電子病歷本體數(shù)據(jù)做挖掘,并通過相似度和信息熵建立電子病歷規(guī)則庫,為醫(yī)生提供電子病歷內(nèi)容信息的語義檢索和分析功能、以及其他病人病歷案例經(jīng)驗(yàn)的對(duì)比分析。
    本文在基于模糊邏輯的基礎(chǔ)上提出一種基于模糊本體的醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)分析方法,它能夠利用領(lǐng)域本體的語義信息對(duì)電子病歷資料和用戶檢索條件進(jìn)行分析和推理,進(jìn)而得出較為準(zhǔn)確的結(jié)果。
    1 系統(tǒng)結(jié)構(gòu)圖
    本文通過模糊本體的支持,構(gòu)建了一個(gè)電子病歷檢索分析系統(tǒng),系統(tǒng)框架如圖1所示:

圖1體系結(jié)構(gòu)圖

    知識(shí)庫中的分詞詞庫采用已有的詞典,醫(yī)學(xué)領(lǐng)域模糊本體由熟悉該領(lǐng)域的專家構(gòu)建。在此基礎(chǔ)上,本系統(tǒng)的具體工作流程如下:① 通過與知識(shí)庫中詞庫的交互,對(duì)電子病歷資料進(jìn)行特征提取,分詞、頻率統(tǒng)計(jì)最終形成關(guān)鍵詞向量;② 與領(lǐng)域模糊本體交互實(shí)現(xiàn)由關(guān)鍵詞向量向概念向量的概念映射轉(zhuǎn)換并提交給特征庫,最后提交給查詢模塊;③ 用戶或應(yīng)用軟件由查詢用戶接口輸入查詢條件,查詢條件處理模塊通過與領(lǐng)域模糊本體的映射將各種的查詢條件轉(zhuǎn)換為結(jié)構(gòu)化查詢條件,并通過模糊本體實(shí)現(xiàn)由關(guān)鍵詞向量向概念向量的概念映射并提交給查詢模塊;④ 查詢模塊完成概念向量的比對(duì)工作,并返回一系列滿足條件查詢的實(shí)例,這些實(shí)例經(jīng)過結(jié)果處理模塊處理后,存放到結(jié)果集并最終返回給用戶。
    2 技術(shù)實(shí)現(xiàn)
    2.1知識(shí)庫的構(gòu)建
    知識(shí)庫是關(guān)于實(shí)體的形式化知識(shí)的實(shí)現(xiàn),它在整個(gè)系統(tǒng)中占有核心地位。在知識(shí)庫中,本體的構(gòu)建是關(guān)鍵。醫(yī)學(xué)語義是對(duì)電子病歷內(nèi)容以及數(shù)據(jù)描述的理解,特定的概念集由一組用戶感興趣的對(duì)象及對(duì)象間的關(guān)系組成。圖2是一個(gè)電子病歷知識(shí)庫本體的一個(gè)實(shí)例,是電子病歷語義本體的部分概念結(jié)構(gòu)圖,表明了概念之間的關(guān)系。  

圖2電子病歷知識(shí)庫本體概念圖

    模糊本體和一般本體最大的區(qū)別在于,模糊本體具有隸屬度的概念存在,所以可以處理不確切的信息?,F(xiàn)今的醫(yī)學(xué)資料庫中含有許多不確切的信息,模糊本體在處理不確切信息上,更具有彈性和優(yōu)勢(shì)。
    因?yàn)閷?duì)象與概念的關(guān)系是對(duì)象和屬性的天系的交集,故據(jù)模糊理論,隸屬度交集取最小值。
    模糊本體產(chǎn)生構(gòu)架大斂如網(wǎng)3所爾:
本文任文獻(xiàn)5的基礎(chǔ)上,對(duì)模糊本體產(chǎn)生構(gòu)架進(jìn)行了改進(jìn),具體的流程如下:
    第1步:由資料庫『fI獲得信息進(jìn)行模糊形式概念分析,建構(gòu)}“模糊概念;
    第2步:對(duì)模糊概念進(jìn)行概念相似度計(jì)‘算,進(jìn)行模糊概念聚類,得劍聚類后之模糊概念層次;
    第3步:由聚類后之模糊概念層次映射產(chǎn)生模糊本體;
    第4步:將建構(gòu)之模糊本體轉(zhuǎn)換為OWl 語言,使本體可被其他應(yīng)用程序所使用,進(jìn)構(gòu)建出語義網(wǎng)構(gòu)架。其中第1步中的模糊形式概念分析包含從確定數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)庫構(gòu)造模糊形式背景、從模糊形式背景構(gòu)造模糊概念。第2步中的模糊概念聚類是采用一定的聚類技術(shù)、依據(jù)結(jié)點(diǎn)問的相似度參數(shù)塒模糊概念上的概念進(jìn)行聚類,生成模糊概念聚類集合,進(jìn)而生成模糊概念層次。第3步中的映射分為:① 給模糊概念層次中的概念節(jié)點(diǎn)一個(gè)標(biāo)識(shí),每個(gè)標(biāo)識(shí)名對(duì)應(yīng)模糊本體中的一個(gè)類名;模糊概念之間的層次關(guān)系對(duì)應(yīng)本體中相應(yīng)類之間的分類關(guān)系。② 本體中每個(gè)類對(duì)應(yīng)的屬性南模糊概念層次中相應(yīng)模糊概念內(nèi)涵對(duì)應(yīng)的模糊語言變量值表示,屬性的值對(duì)應(yīng)形式背景中模糊隸屬度值⑧ 本體巾類的實(shí)例,即模糊形式背景的對(duì)象。
    2.2概念映射
    電子病歷數(shù)據(jù)進(jìn)行特征提取,分詞后形成傳統(tǒng)的關(guān)鍵詞向量空間模型。傳統(tǒng)的天鍵詞向量空問模型是將文檔中的詞條看作孤的個(gè)體單元,沒有考慮詞條彼此間的語義層次關(guān)系和同義、歧義現(xiàn)象,孤立的詞條單九通過該模型計(jì)算后,一般都會(huì)與原文件有較大的語意差距。為此,本文結(jié)合模糊輯的相關(guān)知識(shí),提出了一種基于模糊概念層次的向量空間模。
    3 數(shù)值實(shí)驗(yàn)
    本實(shí)驗(yàn)的領(lǐng)域模糊奪體是根據(jù)臨球診斷、科研以技教
學(xué)等對(duì)電子病歷中CT圖像檢索的需求而構(gòu)建的。針對(duì)CT圖像分成頭部、胸部、腹部、骨盆、其他5大類,每類60幅左右共計(jì)300多幅像構(gòu)成圖像庫對(duì)模糊本體模型基于文本的檢索方法進(jìn)行對(duì)比實(shí)驗(yàn)。
在實(shí)驗(yàn)中,我們選取了查準(zhǔn)率、查全率作為性能測(cè)試標(biāo)準(zhǔn),并采取下圖公式:

 

輸入查詢內(nèi)容為“頭部圖像”,實(shí)驗(yàn)結(jié)果如圖4~5所示;輸入查詢內(nèi)容為“腹部圖像”,實(shí)驗(yàn)結(jié)果如圖6~7所示:

 

通過查看對(duì)比圖可以看到,模糊本體模型在數(shù)據(jù)查全率上性能要比文本檢索高,并且隨著圖像數(shù)目的不斷增加,模糊本體模型在數(shù)據(jù)查全率上性能趨于穩(wěn)定;在查準(zhǔn)率上性能要比文本檢索穩(wěn)定。模糊本體模型充分利用了模糊概念中隸屬度的概念,在處理醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)中存在的不明確信息上具有更大的彈性和優(yōu)勢(shì)。
    4 結(jié)束語
    本文對(duì)傳統(tǒng)電子病歷檢索分析技術(shù)進(jìn)行了研究,在研究模糊本體的基礎(chǔ)上,提出了一種基于模糊本體的電子病歷分析方法,該方法利用了隸屬度的概念,并通過具體的數(shù)值實(shí)驗(yàn)對(duì)其進(jìn)行了性能分析,實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,該方法在數(shù)據(jù)查準(zhǔn)率、查全率上具有良好的性能。
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發(fā)布:2007-04-09 11:24    編輯:泛普軟件 · xiaona    [打印此頁]    [關(guān)閉]
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